جمعت البابا كيرلس السادس بنيافة أنبا ميخائيل مطران أسيوط علاقة محبة عهد إليه قداسة البابا كيرلس السادس بالإشراف علي بناء الكاتدرائية المرقسية بالأنبا رويس بالقاهرة حيث أقام متفرغا إقامة دائمة للإشراف علي عمليات البناء
ومن الجدير بالذكر أن لنيافته مقرا خاصا بمبني المطارنة بالكاتدرائية المرقسية بكلوت بك والذي شيدت في عهد البابا يوساب واستقبل الأنبا ميخائيل قداسة البابا كيرلس فى زيارة تاريخية لدير العذراء فى 18/ 8/ 1960